2014年9月4日台湾地区“食药署”消息，该署已于2013年底完成相关风险评估，依据“农委会渔业署”所提供近两年沿近海及远洋渔船水产品重金属的监测资料，再次提出下修鲸、鲨、旗、鲔、油鱼等水产品甲基汞限值为1 ppm的草案，该草案已完成食品卫生安全与营养咨议会的审查，正办理预告修正征询各界意见的程序。
针对4日媒体报导就现行“水产动物类卫生标准”中对旗鱼等大型回游性鱼类订定甲基汞2 ppm的限值过于宽松一事，食药署强调，相关标准的订定，均系考虑本土性食品的含量背景值、民众摄食量及科学的风险评估结果，据以订定。前“卫生署”曾于2008年预告针对掠食性鱼类下修甲基汞的限值至1 ppm以下，但该草案预告后同时接获境内相关产、官、学机关团体的一致反对，认为此种掠食性鱼类的大型鱼种，鱼体内自然存在的甲基汞含量可能就已超过1 ppm，故未予修正；但为维护民众健康，“食药署”仍持续就该等水产品含甲基汞的风险进行评估，并设计教育倡导文宣及Q&A，于网站、杂志刊物及车厢广告等进行倡导，以教育民众减少甲基汞暴露的风险。
由于汞于水产动物体内主要系以毒性较强的甲基汞型态存在，故台湾地区系以水产动物体内的甲基汞做为风险监测指针，经查国际组织Codex同样是对水产动物体内的甲基汞进行管制，并订有1 ppm的限值；欧盟及澳新虽是针对总汞订定1 ppm的限值，但该标准同样仅适用于水产动物原料，而非加工品；而鱼类摄取量大的日本，则并未针对深海性鱼介类订定汞或甲基汞的限量。反观香港所采取的管理标准，是针对一般固态或液态食品总汞的通则性规定，并非特别针对水产品所订，由于不同食品原料或不同型态的加工食品，其重金属暴露风险应有个别的科学评估依据，故相较于香港管理方式，台湾地区的管理原则及方向，其实更为符合国际趋势。
另外，“食药署”南区管理中心于8月28日会同台南市政府卫生局人员至工厂生产现场进行稽查，除排其它可能的污染源，并针对旗鱼原料进行抽验厘清。针对现存同一来源的旗鱼不同批的鱼原料抽验结果，甲基汞及镉均未检出，铅检出0.03 ppm，均符合台湾地区水产动物类卫生标准限量。
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