2014年12月30日，国家质检总局正式复函省政府，同意设立空港进境水果指定口岸，一举改写安徽省无指定口岸国家级功能平台的历史。空港进境指定口岸坐落于合肥空港经济示范区内，紧邻新桥国际机场货运区和空港保税物流中心（B型），占地面积约10亩，总建筑面积5332平方米，项目总投资约3500万元，主要建设暂扣冷藏库、冷冻库、实验室、查验场等设施，口岸建设标准高，检验设备一流。
12月11日，虽然是星期天，但相关单位放弃休息，加班加点，通力协作，海关实行空中报关，落地放行；国检部门优化流程，快捷高效；运营单位——百大周谷堆公司保障有力，三个半小时，全部完成清关报检流程，创造了水果包机的“合肥速度”。此次包机效率之高，可以和浦东国际机场等发达地区口岸比肩。
下一步，在水果口岸健康运行的基础上，空港办积极谋划其他口岸的申建。目前，冰鲜水产品口岸已获准运行，首批智利三文鱼有望近期进口。食用水生动物、药品口岸已启动申报，计划2017年建成运行。未来，合肥空港示范区将打造成安徽省口岸门类最多、检验最便捷、最具成本优势的口岸高地。并与合肥出口加工区、合肥综保区、空港保税物流中心实现功能互补、联动发展，努力成为安徽（合肥）自贸区的重要组成部分。
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